Отделение хирургии является старейшим клиническим подразделением онкологического центра. После переезда в новое здание онкологического центра, в октябре 2010 г. открыто подразделение абдоминальной хирургии, развернутое на 35 коек. С этого момента отделение возглавляет опытный онкохирург, врач высшей категории – Шаяхметов Ержан Мухатаевич;

С августа 2015 года заведующим отделения назначен Кожагалиев Олжабай Мусаипович, врач онкохирург высшей категории.

С момента своего основания до настоящего времени основные усилия сотрудников коллектива направлены на совершенствование методов диагностики, хирургического и комбинированного лечения больных раком желудка и забрюшинными внеорганными опухолями.

В настоящее время в отделении выполняется весь спектр оперативных вмешательств по поводу опухолей пищеварительного тракта, брюшной полости, забрюшинного пространства, онкоурологической патологии, кожи, разнообразные органосохраняющие операции при опухолях костей.

Широко выполняются расширенно-комбинированные операции с резекцией двух и более смежных органов при местно-распространенных опухолях желудочно-кишечного тракта, опухолях органов малого таза и забрюшинного пространства, ультранизкая передняя резекция прямой кишки с формированием neorectum neosfinkter с использованием одноразовых сшивающе-режущих линейных и циркулярных аппаратов. Также выполняются радикальная цистэктомия с одномоментной илеопластикой, уретероилеопластика. В отделении выполняются симультанные (одномоментные) операции, сочетающейся с сопутствующими заболеваниями, требующими хирургической коррекции (сочетание с желчно-каменной болезнью, различными грыжами, миомой матки и др.).

На­ко­п­лен­ный в клинике абдоминальной онкологии за мно­гие годы опыт, отработанные тех­ни­че­ские де­та­ли опе­ра­ций, внeдpeниe нoвыx тexнoлoгий, дос­ти­же­ния в aнecтeзиo­лo­гии и интeнcивнoй тepaпии пoзвoли­ли зна­чи­тель­но pacшиpить объем оперативных вмешательств у боль­ных с ме­ст­но-рас­про­стра­нен­ны­ми фор­ма­ми рака желудочно-кишечного тракта, что в не­да­ле­ком про­шлом было пово­дом для от­ка­за от ле­че­ния. Се­годня этим пациентам вы­пол­няют­ся сложные ком­би­ни­ро­ван­ные вмешательства.

В течение года в среднем в отделении получают лечение около 600 пациентов. При этом более 90% больных подвергаются различным хирургическим вмешательствам.

В отделении работают высококвалифицированные врачи-онкохирурги, прошедшие обучение в странах ближнего и дальнего зарубежья (Южная Корея, Израиль, США).

В составе отделения:

- врачи-онкохирурги: врач второй категории - Абдикаримов Ануар Маратович, Удовенко Дмитрий Геннадьевич, Омаров  Ерлан Дулатович,                                                                      Акашева Дамира Мейрамбековна;

-  врач-онкоуролог – к.м.н. Давранов Анвар Жангирович.